СУ “Свети Климент Охридски” работи по следните национални програми:

НП „ Без свободен час“
НП „Заедно в изкуствата и спорта“
НП „ Иновации в действие“
НП „Изучаване и съхраняване на традициите и историята на българската армия“
НП „ИКТ в системата на предучилищното и училищното образование“